2009年全市货运总量10.0亿吨，较2004年增长36％。全市共有沿海港口泊位1145个，内河港口泊位1186个，上海港全年完成货物吞吐量5.9亿吨，较2004年增长56％；集装箱专用泊位38个，集装箱吞吐量2500万TEU，增长72％。24个铁路货运站完成货物吞吐量2809万吨，较2004年下降27％。虹桥、浦东两场完成航空货邮吞吐量298万吨，增长54％。全年汽车货运量3.8亿吨，增长19％。

　　2004年～2009年国际航运中心建设取得突破性进展，水路货运分担率快速增长，由2004年51.5％提高到59.2％；公路货运比重较2004年下降5.3个百分点，2009年约占37.7％；铁路货运分担率随货运量下降而加速下滑，由5.3％下降到2.8％；航空货运量增速较大，但由于基数较小，货运分担率维持在0.3％左右。

 　　上海港集装箱集疏运结构不断优化，公-水中转比重由2004年74.2％下降到59.7％；水水中转比重则显著提高，由2004年25.4％提高到40％；铁路中转比重由0.4％下降到0.3％。集装箱公路集疏运主要依靠高等级道路，高速公路周转比重约为70%。长江口附近港区公路集疏运矛盾较为突出。